在蛋白质组学研究中，低丰度蛋白质的精准定量对于疾病早期标志物发现、药物靶点验证以及复杂信号通路解析至关重要。然而，常规数据依赖采集（DDA）方法在面对复杂样本背景和极低丰度目标分子的情况下，往往存在检测灵敏度不足、重现性差的问题。近年来，PRM技术（Parallel Reaction Monitoring）因其高选择性、高重现性和高通量特性，在靶向低丰度蛋白质定量分析中受到广泛关注。本文将系统解析PRM在低丰度蛋白质检测中的技术优势与现实挑战，并分享百泰派克生物科技在该领域的应用经验与技术平台。

一、PRM技术概述：从SRM到PRM的演进

PRM技术是在传统的选择反应监测（SRM/MRM）基础上发展而来的高分辨率靶向质谱技术。核心原理是在高分辨Orbitrap或TOF质谱仪上，全程监测目标肽段的所有碎片离子，提高了定量准确性与特异性。

二、PRM技术的低丰度蛋白质定量优势及挑战

PRM是一种建立在高分辨率质谱平台（如Orbitrap）基础上的靶向定量方法，其工作流程包括：通过LC-MS系统选择特定母离子（precursor），随后对其所有碎片离子（product ions）进行全扫描采集。在数据处理阶段，研究者可根据碎片图谱自由选择最具代表性的离子用于定量，提高了方法的灵活性与特异性。

1、关键优势包括：

（1）高分辨率与质量准确性：Orbitrap系统可提供ppm级质量精度，显著提升目标离子识别能力。

（2）无需预定义过渡离子：与SRM不同，PRM技术可后期灵活选择用于低丰度蛋白质定量的碎片，提高分析深度和结果稳健性。

（3）适用于复杂基质样本：高选择性有助于降低背景干扰，尤其适用于血浆、脑脊液等高动态范围样本。

2、PRM具有天然优势，但在低丰度蛋白质定量检测中仍面临多重技术瓶颈：

（1）靶标肽段响应性差：部分蛋白质肽段本身离子化效率低，易受基质抑制，难以形成稳定信号。

（2）样本复杂性干扰检测：血浆中蛋白质浓度跨12个数量级，目标肽段信号易被高丰度蛋白遮蔽。

（3）方法重现性与线性范围限制：在飞摩尔（fmol）以下浓度范围内，实现跨批次、跨样本的稳定检测，需要高度优化的分析条件与严格质控。

（4）数据分析复杂度高：尽管Skyline等工具可视化良好，但高质量的数据解读仍依赖经验丰富的质谱分析人员，尤其在背景干扰明显时。

百泰派克生物科技集成Orbitrap Exploris 480高分辨质谱系统，结合深度优化的靶向蛋白质组学流程，为科研与临床转化提供灵敏、准确、可重复的PRM定量服务。百泰派克生物科技集成靶标设计、方法开发、样本处理与数据分析全流程能力。我们特别针对低丰度蛋白开发了高灵敏度PRM定量流程，适用于：

• 疾病相关生物标志物验证（如早期肿瘤、神经退行性疾病）
• 药效评价与机制研究中的靶点动态追踪
• 多中心临床样本中的标准化PRM分析

PRM技术为低丰度蛋白质定量的高灵敏度检测提供了可能，尤其在生物标志物验证与临床前研究中展现巨大潜力。未来，随着质谱技术与数据算法的进一步融合，PRM将在精准医疗领域扮演更加核心的角色。百泰派克生物科技将持续推动这一前沿技术的应用，为生命科学研究注入更多可能。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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